يعمل المركز بما يتوافق مع أهداف رؤية "نحن الإمارات 2031" لتطوير بيئة داعمة للابتكار تحفز بناء قدرات الأفراد، وترسخ دور الإمارات كمركز عالمي للابتكار.

كما يساهم المركز في تحقيق أهداف مئوية الإمارات 2071 حيث أن مسيرة الابتكار الحكومي مستمرة لتحسين الممارسات والخدمات الحكومية لضمان بقاء حكومة الإمارات واحدة من أكثر الحكومات ابتكارًا على مستوى العالم.

تتركز مهمة المركز على دعم التحوّل المستمر لآلية عمل حكومة دولة الإمارات من خلال جعل الابتكار ممارسة يومية في العمل الحكومي ومن خلال بناء ونشر مفاهيم أفضل ممارسات الابتكار لمضاعفة الفعالية الحكومية.